On observe la podocnémide de Cayenne dans divers bassins versant de l'Amazonie, soit au Brésil, en Colombie, au Venezuela, au Pérou et en Bolivie. Elle vit en eau douce, dans les rivières et les lagunes saisonnières, et aussi dans les plaines et les forêts inondées.
La podocnémide de Cayenne voit malheureusement la dégradation de son habitat s’accélérer, ce qui entraine un déclin rapide des populations. La pollution des rivières, les perturbations hydrologiques et la disparition des plages de ponte réduisent sa capacité de reproduction.
L’orpaillage, c’est à dire l’extraction de l’or dans le sol, représente aussi une menace sérieuse pour l’espèce, puisque les dragues de sédiment détruisent son habitat. De plus, le mercure utilisé dans ce processus contamine l’eau et s’accumule dans les tissus des tortues, ce qui engendre chez elles des troubles physiologiques.
La coupe forestière aggrave la situation en augmentant l’érosion et en diminuant la quantité d’ombre qui est essentielle à l’équilibre thermique des nids. Enfin, la fragmentation des milieux riverain augmente l’exposition de cette espèce au braconnage.